两边太阳穴胀痛，原因有以下几种：
1、明确是否是头颅本身病变导致的这一症状，需要行头颅核磁共振检查、头颅血管核磁共振检查，必要时行脑CTA检查。
2、颈源性头痛可以有两边太阳胀痛的症状，排除颅内器质性病变之后行颈椎核磁共振检查，由于颈椎间盘突出、颈椎曲度改变、颈椎小关节病变、颈肩部软组织损害以及腰骶部软组织损害，都可以导致两边太阳穴胀痛的症状。通过核磁共振检查，排除器质性病变以后可以行颈神经、颈椎小关节，以及局部筋膜组织的注射治疗来缓解这一症状。