脑干是人体呼吸心跳中枢，调整呼吸心跳节律，脑干的神经纤维集中，也更容易引发瘫痪。因此脑干梗死相比其它部位而言，危险性更高，也更容易引发神经功能障碍，瘫痪，吞咽困难等。但是脑干相比而言耐缺血性更高，多数为小血管病变。因此临床上大面积体积的病灶相对少一点，临床症状并不很重。总体而言，脑干梗死体积若较大，容易引发呼吸心跳障碍，死亡。