宫颈癌四价疫苗的副作用最常见的就是局部的副作用，一般宫颈癌疫苗是在女性的上臂进行注射，注射之后在注射的局部有可能会出现硬结、红肿、疼痛等现象。症状持续的时间要因人而异，有的人甚至持续半个月，局部的症状才会逐渐缓解。
再有就是全身症状，例如发热、晕厥等，但是宫颈癌疫苗全身的副作用发生几率是非常低的，目前临床上的宫颈癌疫苗相对较安全，在临床上还没有明显的不良反应发生。