坐板疮的治疗需要根据病情程度选择合适的方式，对于感染严重者可以选择西医药物抗感染治疗，同时辅助中医内外治疗，氦氖激光治疗，有良好的疗效。多数患者的治疗周期为2~4周。
一、药物治疗
1、莫匹罗星软膏：为局部外用抗生素，可有效消除臀部感染的细菌，促进病灶愈合。在使用前需用生理盐水清洁臀部后涂抹，一般无不良反应，偶见局部烧灼感、蛰刺感及瘙痒等，一般不需停药。此类药物不宜大面积涂抹，避免导致周围健康皮肤损害。
2、红霉素软膏：适于合并感染的患者，属于广谱抗生素，外用于皮肤损害的部位，可以消灭细菌，促进皮损处的愈合。
3、抗生素或磺胺类药物：病情较重患者，应给予抗生素或磺胺类药物治疗，如青霉素、林可霉素注射液，口服阿莫西林、复方磺胺甲唑片等，并补充复合维生素。
二、手术治疗
本病无手术治疗。
三、其他治疗
1、氦氖激光治疗：该治疗方法有照射、刺激、消炎、镇痛和扩张血管功效，可用于穴位照射、体表部照射，促进血液循环，刺激创伤上皮再生和愈合，镇痛止氧、消毒杀菌、吸收渗液和消除水肿都有良好的疗效。
2、免疫疗法：慢性反复发作的病人，可在上臂三角肌处皮下注射疖病菌苗，注射后局部可能有轻度轻度红肿反应，著红肿显著，则应减少注射量，并缓慢递增。