甲状腺舌管囊肿是一种先天性发育性囊肿，源于甲状腺舌管的残余上皮。由于胚胎期甲状腺形成过程中，甲状腺舌管退化不全，遗留在颈深部的组织内，在管腔内上皮产生分泌物，积聚而形成。
甲状腺舌管囊肿的发生与性别没有关系，男女均可发生，可以发生在任何年龄，但30岁以下的青少年比较多见。囊肿主要发生在颈前正中，舌盲孔至胸骨切迹之间的任何部位，甲状腺舌管囊肿可以造成吞咽、言语功能障碍。
甲状腺舌管囊肿的治疗应该在耳鼻喉科进行，主要是通过手术切除来治疗。