右心血栓合并肺栓塞的治疗方法主要有溶栓，肝素抗凝和外科取栓术，这些方法各有特点，溶栓治疗可以快速的恢复肺灌注，降低肺动脉压力，改善右心衰，但是它也可能造成血栓快速崩解，使已有的血栓的肺组织加重病情，还有发生出血的并发症。外科取栓术更适合于有溶栓禁忌症，或者溶栓后效果不佳的血流动力学不稳定的患者，但这种手术要求比较高，只能在有经验的中心进行，国外的文献的报道，单纯抗凝的死亡率高于外科取栓和溶栓治疗，因此右心血栓合并肺栓塞的治疗，优选溶栓治疗和外科取栓术。