脂肪肝转氨酶轻度升高时，可以给予饮食控制，要予低脂饮食，即低碳水化合物、高蛋白及高维生素进食，还有适当的运动，运动锻炼不要过于剧烈。要注意消除病因，如是引起饮酒引起的脂肪肝，要注意戒酒，药物引起的脂肪肝要停用可能的药物。如果是血脂高，可以应用降脂药物，如果是糖尿病，一定要控制好血糖。
如果转氨酶轻度升高可以不应用保肝药物，随着脂肪肝的逐渐改善，肝功能可以恢复正常。如果谷丙转氨酶明显升高，可以加用保肝药物，如肝乐片、水飞蓟宾、多烯磷脂酰胆碱、S-腺苷基甲硫氨酸等。同时要监测肝功能，此时要慎用降脂药物，以免加重肝脏损伤。脂肪肝的治疗要循序渐进，这是一个持之以恒的过程。