小儿感染性心内膜炎后，一般治疗都是使用大量的抗生素治疗再使用一些对症治疗的药物。如果药物没有效果需要及时进行手术换瓣治疗。出现全身性感染、心脏瓣膜疾病、动脉栓塞等症状后需要及时治疗。当累及心脏瓣膜时，也可累及室间隔缺损处、心内壁内膜或动脉导管未关闭时，最好及时手术治疗。当出现肾病和脑病时说明已经有严重合并症了，这时需要及时手术治疗进行换瓣膜。