霉菌性阴道炎少数的患者可以通过性交接触传染，例如有些男性携带念珠菌或者包皮过长，没有做包皮环切的男性，其配偶患病的风险会增加。但是霉菌性阴道炎主要的传播途径是内源性的传播，念珠菌除寄生于阴道，也可以寄居在人的口腔、肠道。病原体在不同的寄生部位之间会互相的传染，一旦条件合适就可以引起感染，少数患者通过间接传染而被感染，可以通过接触污染的衣物而间接被感染。