主动脉夹层手术属于比较大型的手术，手术比较复杂、手术时间长、影响的脏器比较多，所以术后可能发生的并发症也相对较多。主动脉夹层术后经常发生的并发症有：神经系统并发症，后遗症有：脑血管意外、截瘫等情况，部分脑血管意外可以恢复，少部分可能遗留有脑血管疾病后遗症；泌尿系统并发症、后遗症有：早期可能会有急性肾衰的发生，通过治疗大多的急性肾衰可以恢复，仅有少部分患者可能遗留有慢性肾功能不全等后遗症；另外，主动脉夹层支架置入术后也可能会有支架内漏的情况，也是主动脉夹层手术的后遗症之一。