松果体主要分泌褪黑素，该激素可使两栖类动物皮肤颜色变浅，在人体并无该作用，而是抑制垂体--性腺轴的活动，有防止儿童性早熟的作用。当松果体遭受病损分泌不足时，可出现性早熟，生殖器官过早发育。此外，褪黑素还有调节生物体昼夜节律、睡眠、情绪等功能。如果出现松果体分泌异常，首先必须完善头部磁共振检查，结合脑积液血清中肿瘤标记物的检测明确诊断，治疗以联合治疗为主。