肛门疼痛的形成原因较多，常见的原因有:1、血栓性外痔，表现为肛缘隆起性肿物，疼痛，伴有水肿，肿物内可见紫黑色血栓。2、肛裂，表现为排便时肛门周期性疼痛，便血和便秘，检查时肛管可以呈梭形裂口。3、肛周脓肿，肛门周围疼痛，疼痛部位可触及肿块，并有红、肿、热、痛等急性炎症表现，肿块可有波动感，全身症状可伴有发热等症状。4、肛门神经痛，表现为不明原因的肛门疼痛，各项检查都是正常的。