偏侧舞蹈症治疗包括病因治疗和对症治疗，偏侧舞蹈症的部分患者是由于脑血管病所引起，则需针对脑血管病进行治疗，如为缺血性脑血管病则给予抗血小板等药物进行治疗，如为出血性脑血管病则可给予神经脑保护治疗。
还有的偏侧舞蹈症无明确病因，则需根据舞蹈症的症状给予对症治疗，如给予抗胆碱能药苯海索等进行治疗可以控制症状，也可给予一定的镇静剂，如地西泮或氯硝西泮等进行治疗。患者还可适当的使用巴氯芬或卡马西平治疗，也可能有效。