枸橼酸氢钾钠来进行溶石治疗，是一种辅助治疗，并非结石治疗的主要手段，因此治疗效果并不明显。治疗结石是通过化学的方法溶解结石或者结石碎片，达到完全清除结石的目的，是一种辅助治疗手段。枸橼酸氢钾钠通常作为体外冲击波碎石、经皮肾镜取石、输尿管镜碎石，以及开放手术取石后的辅助治疗，主要用于尿酸结石和胱氨酸结石的治疗，治疗手段包括口服药物、增加尿量、经肾造瘘管注入药物等。
目前在胱氨酸结石和尿酸结石的治疗当中，主要碱化尿液的药物就是枸橼酸氢钾钠，通常调节尿液的pH值在6.5-7.0之间。同时要进行大量饮水，使尿量超过2000-2500mL，限制食物的摄入，从而达到溶解结石的目的。