肺念珠菌病是念珠菌所引起的急性或慢性的支气管炎，肺部的感染，在肺部真菌感染中比较多见，大多为院内感染，能占到真菌感染的一半以上，在监护室比较多见。治疗针对病因的治疗，去除诱发的因素，比如激素免疫抑制剂，增强机体的免疫功能。患者注意休息，预防受凉，加强个人的营养支持。
一、药物治疗
需根据致病念珠菌的种类和药敏试验选择合适的抗真菌药物。
1、两性霉素B：两性霉素B、去氧胆酸盐以及3种含脂复合制剂，治疗敏感性略差的光滑念珠菌或克柔念珠菌所致者。
2、三唑类：包括药物有伏立康唑、氟康唑、伊曲康唑，伏立康唑对念珠菌属的抗菌活性高于氟康唑及伊曲康唑。
3、棘白菌素类：目前仅有静脉制剂，临床不良反应少见，包括卡泊芬净、米卡芬净、阿尼芬净。
4、氟胞嘧啶：常与两性霉素B去氧胆酸盐联合治疗。
二、手术治疗
念珠菌球或局限性肺部病变药物治疗效果不佳者，但全身情况能耐受手术者，可考虑手术治疗。