嗜酸性粒细胞增多-肌痛综合征的发病原因目前尚不清楚。嗜酸性粒细胞增多-肌痛综合征可能与L-色氨酸中的某些物质有关。
一、主要病因
摄入L-色氨酸：L-色氨酸又名α-氨基吲哚基丙酸，是人体必需氨基酸之一，为白色至黄白色晶体或者呈结晶性粉末状。没有气味或微臭，长时间光照会着色。与酸在暗处加热比较稳定，与其他氨基酸、糖类、醛类共存时极容易分解。常用作食品强化剂、抗氧剂，也用于医药等方面。L-色氨酸中含有微量色氨酸二聚物，这种化学物质可能是嗜酸性粒细胞增多-肌痛综合征的致病因子，或者还有另一种尚未识别的物质起作用，确切发病原因目前尚不清楚。
二、诱发因素
食用营养增补剂、抗氧化剂和安神药：营养增补剂、抗氧化剂和安神药中多含有L-色氨酸，L-色氨酸中含有微量色氨酸二聚物，其可能是导致嗜酸性粒细胞增多-肌痛综合征发病的致病因子之一。