大部分肺结核患者早期能够治好，肺结核只要经过积极治疗，给予早期、规律、全程、适量、联合治疗原则，大部分患者能够治愈。
只有极少部分患者如果不规则治疗，如不按疗程服药，不按药物的剂量或漏服药物，患者可能会出现复治涂阳肺结核或者是耐药肺结核，患者的治疗疗程就会延长，甚至迁延不愈。尤其是耐药肺结核，耐药肺结核治疗期比较长，可达20个月甚至更久，所以预防耐药肺结核的最佳策略是实行DOTS策略，也就是全程督导化学治疗。患者每次用药必须在医务人员，或在经培训的家庭成员的直接督促下进行，因故未用药必须采取补救措施，以保证按医嘱规律用药，使初治涂阳患者在良好的管理下达到高治愈率。还要加强耐药肺结核的及时发现，并给予合理治疗，阻止其传播。