暴露性角膜炎需要与匐行性角膜炎、绿脓杆菌性角膜炎等疾病鉴别。
1、匐行性角膜炎：由毒力较强的细菌引起。常见的有肺炎球菌、溶血性或绿色链球菌、淋球菌、枯草杆菌、金黄色葡萄球菌等。常有角膜表面外伤史，或有灰尘等异物入眼。全身营养不良易于发病。可通过表现为黄白色化脓性溃疡与暴露性角膜炎相鉴别。
2、绿脓杆菌性角膜炎：由绿脓杆菌直接侵入角膜引起感染所致。绿脓杆菌必须通过破损的上皮才能侵犯角膜组织引起感染。各种角膜外伤、角膜炎、角膜软化症等均可成为本病的诱因。可通过细菌培养出绿脓杆菌来与暴露性角膜炎相鉴别。