1、视诊：通过观察患者皮损的部位、颜色、形状、大小来帮助诊断疾病。
2、触诊：医生用手直接感受患者皮损的状态、质地、软硬等。
3、组织病理学检查：组织学表现为表皮角化过度伴角化不全，棘皮层不规则增厚，常呈假上皮瘤样增生，表皮内不典型的淋巴细胞浸润，胞质少，淡染、嗜酸性，细胞核大，深染，核形不规则，可见核分裂象，核周有空晕，多个聚集成巢时，甚似Pautrier微脓肿。表皮基底膜完整，分界清楚，真皮浅层可见成熟淋巴细胞及组织细胞，偶尔也可见极少量不典型细胞。
4、免疫组化检查：佩吉特病样网状细胞增生症免疫组化主要表现为CD3(+)，另外CD4(+)/CD8(-)、CD4(-)/CD8(+)，或者CD4(-)/CD8(-)，其中CD8(+)/CD4(-)占53%，CD4(+)/CD8(-)占36%，而CD4(-)/CD8(-)占11%，有47%的病例可高表达CD30，50%～60%的病例Ki-67增殖指数高表达，部分病例也可以反常呈CD20阳性。
5、基因重排和流式细胞仪检测分析：有报道佩吉特病样网状细胞增生症TCRβ和γ基因重排。流式细胞仪检测分析示瘤细胞内DNA含量异常。
6、皮肤镜：为皮肤科常规检查，通过此项检査医生可初步明确诊断，并根据病变的形态、深度和范围拟定出初步的治疗方案。