目前对穿孔性直肠癌患者均主张行外科手术治疗，尤其是急性穿孔所致的腹膜炎患者。直肠癌穿孔后出现的腹膜种植转移常提示腹膜腔内转移，但如果转移只局限在腹壁内，进一步的积极手术切除可使疾病得到有效控制，且并发症发生率和死亡率均降低。
一、急症治疗
无论是术前确诊还是剖腹探查后诊断的病例，一旦提示为结直肠癌破裂穿孔必须立即行手术治疗。治疗该疾病主要有效手段即为切除病灶，只要情况容许下争取行一期切除。
二、药物治疗
1、靶向药物：能够精准识别、打击肿瘤细胞，巧妙地避开正常细胞组织，常用药物包括贝伐珠单抗、曲妥珠单抗等。
2、免疫治疗：其作用为激活体内免疫细胞，向肿瘤细胞发起攻击，常用的免疫抑制剂，如纳武利尤单抗、帕博利珠单抗等。
三、手术治疗
对于腹膜反折以上的上段直肠船的游离性穿孔，多合并急性弥漫性或局限性腹膜炎，首先紧急纠正全身情况如控制感染性休克、纠正水、电解质和酸碱平衡之后急诊手术。进入腹腔后先尽可能封闭穿孔肠壁，冲洗腹腔，如全身情况较轻、腹腔污染程度不严重、肠壁水肿较轻、肿瘤局部情况浸润轻等可考虑术中清洁灌肠、一期切除吻合，切除范围按照手术标准包括足够的肠管和系膜、1~3站淋巴结清扫。如肿瘤无法切除者术中清沽灌肠后行近端结肠双腔造口，置管引流，术后恢复后根据情况进行放化疗以降期，二期手术切除。如肿瘤无法切除时肠管溃破处难以缝合封闭，可以覆盖大网膜后双腔造口。对于患者全身状况较差、肠壁水肿较重、腹腔污染严重者宜行 Hartmann手术。
四、化学药物治疗
杀伤肿瘤细胞、抑制肿瘤细胞生长繁殖，患者一般接受以氟尿嘧啶为基础药，可联合奥沙利铂、亚叶酸钙等治疗。
五、中医治疗
某些中医中药可辅助抗肿瘤，减轻放化疗不良反应，提高生存质量。