目前对于睑板腺癌的发病机制不是十分明确，睑板腺癌发病可能与种族和基因有关，同时导致癌变的环境因素也是导致睑板腺癌发生的可能病因。
一、主要病因
1、基因突变：nm23基因、癌基因、Bcl-2基因的过量表达，证实与睑板腺癌的发生有关。
2、环境因素：睑板出口阻塞易导致睑板分泌物潴留，潴留物质长期刺激易导致睑板腺癌发生。
二、诱发因素
1、长时间紫外线照射：长时间紫外线刺激易导致睑板腺癌的发生。
2、眼部卫生差、长时间用眼不良：是引发睑板腺癌的诱因，起初患者可表现为睑板腺囊肿。
3、免疫力低下：免疫力低下时，机体对肿瘤清除能力减弱，会导致肿瘤细胞趁虚生长。