人乳头瘤病毒感染后，如果未及时治疗，严重时可出现宫颈癌、肛门直肠尖锐湿疣、尿路感染等并发症。
1、宫颈癌：人乳头瘤病毒感染宫颈，患宫颈癌的几率增大。宫颈癌主要临床表现为阴道出血，但大部分患者属于接触性出血，如同房后、阴道检查后、排便后，出血量多与病灶部位及病灶大小有关。
2、肛门直肠尖锐湿疣：可出现肛门内胀感、便血、排便不畅或排便时疼痛。
3、尿路感染：尿道口尖锐湿疣还可出现尿频、尿急、尿痛、尿流曲线改变等，极少数发生尿道内病变或累及膀胱。