继发性痛经是指由盆腔器质性疾病引起的痛经，如盆腔炎、子宫发育不良、子宫内膜异位症等，其中子宫内膜异位症是继发性痛经的常见原因。
1、子宫内膜异位症：子宫内膜异位症引发的痛经占继发性痛经的60％左右，由于某些因素影响，子宫内膜异位到子宫内膜以外的其他地方，并随月经一样周期性脱落，就叫子宫内膜异位症。但这些出血没有通道排出体外，而是在局部瘀积，形成囊肿，越来越大，局部的炎症反应刺激局部神经引起疼痛。
2、子宫腺肌病：子宫内膜出现在子宫肌层，则称为子宫腺肌症。子宫腺肌症与女性内分泌激素特别是雌激素有关，妇女育龄期是子宫腺肌症的高发期。但其发生机制目前尚不明确，一般表现为痛经和月经失调，多数会引起不孕不育。疼痛的特点和性质与子宫内膜异位症相似，但更加严重。
3、盆腔炎：盆腔炎引起的痛经约占继发性痛经的30％，导致盆腔炎症的常见因素有分娩或人工流产、宫腔放环、取环手术、输卵管通液术、输卵管造影术等，如果术后消毒不严格或原有生殖系统炎症，有可能引起术后感染。也有的患者术后不注意个人卫生或不遵守医嘱，有性生活，同样可以使细菌上行感染，引起盆腔炎。女性月经期不注意卫生，如使用不合格的卫生巾、卫生纸或有性生活，也可能诱发盆腔炎。患有盆腔炎的女性在非月经期会有小腹隐痛感，在月经期痛感加重，往往还伴有发烧。
4、盆腔静脉淤血综合征：约10％的继发性痛经是由盆腔静脉淤血综合征引起的，盆腔静脉淤血综合征是由于慢性盆腔静脉血液流通不畅，以及盆腔静脉充盈、淤血所引起的一种疾病，其临床特点为“三痛、两多、一少”，即盆腔坠痛、低位腰痛、性交痛，还有月经多、白带多，妇科检查阳性体征少。
5、生殖道畸形：在胚胎发育中一侧副中肾管发育良好，形成发育较好的单角子宫，而另一侧副中肾管发育不好，形成残角或始基子宫，与对侧不贯通，也不通向体外。始基子宫一般无宫腔或有宫腔也缺乏子宫内膜，如果始基子宫有功能反应，表现为周期性出血，则可因宫腔积血而引起痛经。
6、宫内节育器：痛经亦可见于放置宫内节育器的妇女，此类痛经可能是子宫内膜产生的前列腺素增加引起的，也可能是由于节育器刺激子宫肌肉的排异性收缩，导致下腹部痉挛性疼痛。患者常有下腹部或腰骶部不适，经期症状加重，表现为痛经。节育器放置位置不当也易引起子宫收缩，导致下腹疼痛及痛经。
7、子宫肌瘤：痛经不是子宫肌瘤的主要症状，但黏膜下肌瘤在月经期可因刺激子宫收缩而发生痉挛性疼痛，患者多伴有月经过多、经期延长或不规则阴道流血，盆腔检查可发现子宫不同程度增大，表面光滑或有结节状突起。