急性胃肠炎引起发烧需要针对性地服用抗菌素。急性胃肠炎引起发烧考虑存在病菌感染的可能，需要做血常规检查，如果白细胞比较高说明存在炎症，就需要针对性的服用黄连素、左氧氟沙星等抗菌素。
同时注意腹泻情况以及体温的变化，如果腹泻症状比较严重的需要服用肠炎宁、蒙托石散等药物，体温在38.5℃以下的可以通过温水擦浴以及退热贴进行降温，如果体温超过38.5℃需要服用退热药，比如扑热息痛、布洛芬等，最好是去医院在医生的指导下进行系统性的用药。