常用的妇科肿瘤标志物有CA125、NB70/K、CA19-9、AFP、CEA、SCCA等，可以辅助诊断子宫颈癌、子宫内膜癌、卵巢癌、内胚窦瘤等恶性妇科肿瘤，也可以间接诊断子宫内膜异位症。还可以检查妇科肿瘤相关癌基因和肿瘤抑制基因，如Myc基因、C-erb B2基因、P53基因等可以辅助诊断上述肿瘤，还可以定期复查肿瘤标志物看治疗的效果和复发的可能性。