食管念珠菌感染主要症状可表现为食管的吞咽困难，胸骨后疼痛，严重者可伴有咽喉部的疼痛，甚至呕血症状的发生，可见发热症状的伴随，有些患者会有口腔部的感染可见鹅口疮。
一、典型症状
1、吞咽困难：食管念珠菌感染导致食管黏膜充血、水肿严重，在进食时可能会出现食物的吞咽困难。
2、咽疼吞咽疼：食管念珠菌感染累及咽喉部时，由于炎症反应会导致表面的红、肿、热、痛。
3、口腔感染：食管念珠菌感染时可累及口腔部，部分患者会出现鹅口疮的情况。
4、厌食呕血：由于食管部的炎症吞咽困难会导致患者厌食，食管表面黏膜的损伤脱落，会出现呕血现象。
二、其他症状
1、食管狭窄由于食管念珠菌感染导致食管炎症表现瘢痕肉芽肿的出现。
2、真菌引起的梗阻大量真菌繁殖聚集导致食管梗阻的发生。
3、休克大量真菌繁殖，重者导致中毒休克昏迷。