吃酵素后肚子疼一般考虑是药物的不良反应，一般用药还是要考虑自身体质的，不要盲目用药，特别是一些胃肠消化功能较弱的人群，更不能随意吃，特别是对胃肠有刺激性的药物。如疼痛不明显，可以通过减少酵素的服用量来减轻肚子疼的症状，每天少喝一点，然后逐渐增加服用量，等身体慢慢适应以后可能就会好转，如疼痛明显，建议停止服食用。