赤藓糖醇对于肾脏没有明确的影响，赤藓糖醇是由淀粉发酵而来，发酵以后可以作为代餐糖。因为赤藓糖醇的发热率比较低，仅仅相当于蔗糖的1/10。所以它虽然具有蔗糖的口感，但是并不能让人体血糖或者是糖代谢有一定的变化。属于比较安全的代糖食品。
赤藓糖醇在体内也并不参与代谢，主要通过肾脏从血液中排到尿液中，从而排出体外，对于肾脏也没有明确的影响，所以赤藓糖醇适合于糖尿病患者食用。