肝脓肿严重时可引起并发症，因此建议肝脓肿患者在医生指导下积极治疗，以防病情加重，常见的并发症具体如下：
1、肝右叶脓肿穿破肝包膜形成膈下脓肿。突破入右侧胸腔可导致脓胸。左叶脓肿可穿入心包导致心包填塞和休克。脓肿如向腹腔穿破，发生急性腹膜炎。
2、少数情况下，肝脓肿可穿破血管和胆管壁，引起大量出血并从胆道排出，临床表现为上消化道出血。