服用抗结核药物是治疗骶髂关节结核的关键，坚持早期、规律、全程、适量、联合的原则，必要时在药物治疗配合下行手术治疗。术后卧床休息2~3个月后才可下床活动，并且继续抗痨治疗6~12个月。
一、一般治疗
1、支持治疗，注意休息、避免劳累，合理加强营养。
2、做好活动期结核病人的隔离工作，避免传染。
二、药物治疗
1、异烟肼：单一抗结核药物中杀菌力最强者，特别是早期杀菌力。其对巨噬细胞内外的结核分枝杆菌均具有杀菌作用。最低抑菌浓度为0.025~0.05ug/ml，口服后迅速吸收，血中药物浓度可达最低抑菌浓度的20~100余倍。脑脊液中药物浓度也很高，偶可发生药物性肝炎，所以肝功能异常者慎用，需注意观察。
2、利福平：最低抑菌浓度为0.06~0.25μg/ml，对巨噬细胞内外的结核分枝杆菌均有快速杀菌作用，特别是对C菌群有独特的杀菌作用。其与异烟肼联合应用，可显著缩短疗程。口服1~2小时后达血药峰浓度，半衰期为3~8小时，有效血药浓度可持续6~12小时。而且加大药量，则持续时间更长。利福平及其代谢物为橘红色，服后大小便、眼泪等为橘红色，为正常现象。
3、吡嗪酰胺：具有独特的杀菌作用，主要是杀灭巨噬细胞内酸性环境中的B菌群。在6个月标准短程化疗中，其与异烟肼和R利福平联合用药，是三个不可缺的重要药物。常见不良反应为高尿酸血症、肝损害、食欲缺乏、关节痛和恶心等。
4、乙胺丁醇：其对结核分枝杆菌的最低抑菌浓度为0.95~7.5μg/ml，口服易吸收。不良反应为视神经炎，用药前及治疗过程中应密切观察视力情况。
5、链霉素：其对巨噬细胞外碱性环境中的结核分枝杆菌有杀菌作用。不良反应主要为耳毒性、前庭功能损害和肾毒性等，应严格掌握使用剂量，儿童、老人、孕妇、听力障碍和肾功能不良等要慎用或不用。
三、手术治疗
1、病灶清除术：根据病灶情况，选择前方或后方入路进入病灶。寒性脓肿在髂窝者，可采用前方低位倒八字切口，其余采用后侧入路。
2、植骨术：一种为关节内植骨。如无混合感染，在病灶清除的同时行关节内植骨融合。另一种为关节外植骨，用于病灶已静止。但局部疼痛明显者，可做关节外单纯植骨融合术。