单纯的甲状腺炎，不伴有甲亢或者甲减的情况，仅仅是相关的自身免疫性抗体的升高，叫自身免疫性甲状腺炎，例如桥本甲状腺炎、亚急性甲状腺炎，这些都是属于自身免疫性甲状腺炎，可以吃一些保护甲状腺的药，最常见的就是硒酵母片。
如果是亚急性甲状腺炎，往往还可以引起甲状腺局部的疼痛，并且向颈部或者头部的其他部位有放射痛，这样的疼痛还往往伴有轻中度的发烧，也应该对症治疗，给予降热、解表、抗炎的药物，一般可以用非甾体类药物，也可以适当用清热解毒的抗病毒中成药来综合治疗。对于甲状腺炎主要是保护甲状腺的治疗和一些对症的处理，病毒性感染的甲状腺炎有一定的自限性，而没有什么特殊的方法，治疗的时间是三个月到半年左右。