不用部位的念珠菌病的症状不同，可表现为皮肤、黏膜局部性感染症状，也可以造成多器官组织系统性念珠菌感染症状。可引起发热、食欲缺乏等症状。
1、皮肤念珠菌病：
（1）念珠菌性间擦疹：发生在腋窝、腹股沟、乳房下、会阴部及肛门周围处，和周围组织界限清晰的皮肤红斑及糜烂，散在丘疹、水疱和脓疱，常表现为中心区域密集、周围疏松，伴有瘙痒感。
（2）念珠菌性甲沟炎和甲床炎：甲沟化脓、红肿，常伴有糜烂和渗出，指甲或趾甲变厚并呈现淡褐色。
（3）念珠菌性肉芽肿：表层覆盖有黄棕色痂，内含丰富血管的丘疹。
（4）慢性皮肤黏膜念珠菌病：患者的皮肤、黏膜和甲沟的慢性、复发性、持久性、念珠菌感染，一般常发生于伴有多种全身疾病或免疫功能障碍的患者。
2、黏膜念珠菌病：
（1）口腔念珠菌病：鹅口疮，常发生于舌、齿龈、软腭及颊黏膜，严重可累及气管、食管等，常表现为口腔黏膜上附有灰白色薄膜，边界清晰，周围有红晕。刮去假膜后可见红色的湿润面，出现轻度的出血或糜烂，严重可致黏膜溃疡、坏死。
（2）念珠菌性唇炎：分为糜烂性念珠菌性唇炎和颗粒性念珠菌性唇炎。前者表现为唇红中央为鲜红糜烂状，周围过度角化，表面脱屑，呈现黏膜白斑；后者表现为下唇呈现弥漫性肿胀，唇红以及皮肤的交界处边缘有小颗粒并微微凸起。
（3）念珠菌性口角炎：唇部单侧或者两侧口角浸渍呈白色，糜烂或者结痂。
（4）念珠菌性阴道炎：外阴部红肿、剧烈瘙痒伴有灼烧感，阴道壁红肿，阴道黏膜附有鹅口疮样的灰色假膜。呈红斑、轻度湿疹样反应、脓包、糜烂或者溃疡，皮损可扩展至外阴及肛门。阴道白带会呈现黄白色凝乳状或乳酪状，有时可呈现豆腐渣样，无恶臭味。
（5）念珠菌性包皮炎：包皮处出现轻度潮红，冠状沟处出现附有白色乳酪样斑片和鳞屑性丘疹，严重时局部会出现红肿、糜烂、渗出、尿频和刺痛等症状。
3、系统性念珠菌病：
（1）呼吸性念珠菌病：表现为支气管炎、肺炎或形成类似肺结核的空洞，病变可扩展延伸至大叶性肺炎，患者出现咳嗽、发热、咳血、高热、胸痛等症状；慢性的患者可能伴有胸膜炎或者胸腔出现积液。
（2）消化系统念珠菌：多见于婴幼儿，表现为进食不适、吞咽困难、腹泻、排泄物呈水状或豆腐渣样，呈黄或绿色，偶有便血。
（3）泌尿系统念珠菌病：常表现为膀胱炎、肾盂肾炎，患者会出现尿频、尿急、排尿困难，甚至血尿。
（4）中枢神经系念珠菌病：患者可出现发热、头痛及脑膜刺激征等症状。
（5）念珠菌菌血症：可累及全身多个组织和器官，患者出现长期发热。
（6）念珠菌性心内膜炎：患者出现发热、贫血、心力衰竭等症状。
4、念珠菌所致变态反应：如发生于消化道，可表现为类似胃炎或结肠炎的症状；如发生于呼吸道，可表现为类似过敏性鼻炎或哮喘症状。