造成肌肉酸痛的原因有很多，最常见的原因是由运动引起来的肌肉酸痛，通常在运动后数小时到24小时之内出现，一般持续的时间在1-3天，绝大多数人群经过短暂的休息后会逐渐的自我恢复，无需特殊处理。
运动造成肌肉酸痛的原因，是肌肉组织中葡萄糖不能完全氧化只能转换为乳酸，当乳酸在肌肉组织中大量堆积后，刺激肌肉组织中的神经末梢，引起酸痛的感觉。除了运动造成的肌肉酸痛，一些常见的骨科疾病，比如颈椎椎间盘突出、腰椎椎间盘突出、椎管狭窄、椎体滑脱压迫了肌肉神经后，也可以导致四肢肌肉的酸痛。另外全身性的肌肉酸痛常见于各种原因导致的感冒、发烧等等。