单纯性甲状腺肿是由于多种原因引起来的甲状腺肿。可能的病因首先是缺碘。缺碘是地方性甲状腺肿最常见的病因，主要由于土壤、水源、食物中含碘很低，不能满足机体对碘的需要，而影响了甲状腺激素的合成。其次是致甲状腺肿的物质引起甲状腺肿，某些物质可以阻碍甲状腺激素的合成，从而引起甲状腺肿。比如保泰松，碳酸锂。第三个病因是先天性甲状腺激素合成的障碍，某些酶的缺陷影响甲状腺激素合成，从而引起甲状腺肿。