化疗是晚期常用的治疗方式，由于胆囊癌对各种化疗药物均不敏感，经常用于手术后辅助治疗，化疗的方式也是有很多种，有全身性的和介入化疗是常用的治疗方法，胆囊癌介入化疗最有效的是(超)选择性胆囊动脉或肝动脉灌注化疗技术。全身性化疗是对于根治术后化疗和不能手术者，或胆囊癌术后复发的患者应用。