小儿单心室并发症一般有低氧血症、心律失常及低心排综合征等。当并发症出现时，说明疾病已经是比较严重的，此时应该要马上到医院做治疗，耽误的时间越久，治疗的预后效果越差。可以采用手术的方式做治疗，通过手术治疗把单心室隔为两心室。手术治疗方法有姑息性手术、心室排外手术等，具体采用哪一种方法医生会根据患者的病情来给予建议的。