慢性鼻-鼻窦炎的发病原因非常复杂，传统的观点认为感染、变态反应、鼻腔鼻窦解剖学异常是三大主要致病因素，这些致病因素经常交叉在一起。随着近些年来对鼻腔鼻窦黏膜炎症研究的进展，对慢性鼻-鼻窦炎的病因和发病机制和治疗理念有了新的认识。
一、主要病因
1、急性鼻窦炎：这是慢性鼻窦炎的首要病因。患者急性期因为治疗不当或没彻底治疗，导致反复发作、长时间无法痊愈，转为慢性。
2、阻塞性病因：如鼻息肉、鼻甲肥大、鼻中隔偏曲、肿瘤等。
3、未控制的牙源性感染：因上磨牙的牙根与上颌窦底部紧挨着，牙髓炎容易向上迁移发展成为慢性上颌窦炎。
4、外伤和异物：鼻部或上颌窦发生外骨折、异物存留或血块感染等。
5、鼻窦解剖因素：由于各个鼻窦特殊的甚或异常的解剖构造，不利于通气引流，亦为一不可忽略的自身因素。
6、变应性因素：近年来人们在变应性因素对慢性鼻窦炎的影响或两者之关系等方面的认识日益提高。曾有人认为由变应性因素而致的慢性上颌窦炎占60%~80%。
二、诱发因素
1、外在因素  ：如正常通气和黏膜引流障碍，多由手术、感染和外伤所致。   
2、遗传因素：黏膜纤毛结构和功能障碍诱发。
3、一般性因素：如有全身性慢性疾病，营养不良，烟酒嗜好及疲劳过度等各种原因，机体抵抗力低下时，易罹患本病。