阴天、下雨时肩膀疼的情况，一般和以下几种原因有关系：
1、阴天下雨时可以造成寒冷、潮湿，一般刺激肌肉后会有肌肉的酸痛。如果既往有慢性损伤，如肩袖损伤、肌肉紧张、粘连、炎症物质渗出等情况，遇到这种不良天气，寒冷刺激血管、神经和肌肉收缩后会出现疼痛。
2、肩膀本身有一些慢性损伤，特别是一些骨科疾病，比如肩峰炎症、骨质疏松，以及局部增生、粘连等。在遇到寒冷天气时，疾病因素也会受到刺激，从而造成疼痛。
3、阴天、下雨的寒冷刺激还会影响到其他疾病，比如颈椎病的引起的放射疼，也会造成肩膀疼，患者需要检查清楚，进行对症治疗。