黄连素又称小檗碱，是中成药，有显著的抑菌作用，能对抗多种病原微生物，尤其对痢疾杆菌、大肠杆菌作用较强，另外黄连素还有清热解毒作用，对风火牙痛、目赤肿痛、口舌生疮等的疾病有辅助治疗作用。黄连素的副作用主要是由于味苦引起的“苦败胃”作用，即胃肠道反应。对黄连素过敏者禁用，遗传性6磷酸脱氢酶缺乏儿童禁用（因可引起溶血性血）。黄连素其他方面的副作用较小。另外，口服黄连素后24小时内禁止饮茶等含有鞣酸的饮品，因为黄连素和鞣酸能生成难溶性鞣酸盐，降低疗效。儿童（包括婴幼儿）可以口服黄连素，由于黄连素味苦，建议饭后半小时至一小时口服，以避免呕吐。