输卵管发育异常的治疗方案要根据患者的病情和需求。轻微异常不影响怀孕，无需治疗。发生宫外孕或者是严重的畸形影响正常怀孕需要手术治疗。输卵管发育异常多数不需要治疗，发生异位妊娠需要短期治疗约1~2周。
一、药物治疗
 输卵管发育异常以手术治疗为主，无有效药物治疗。
二、手术治疗
1、输卵管切除术：手术过程中认真检查，特别是输卵管妊娠破裂者。一般不建议轻易切除输卵管，特别是有生育要求者。年龄较大的患者无生育要求，可以选择输卵管切除术；再就是输卵管严重畸形，没有保留的必要，以防再次出现宫外孕，需要做输卵管切除术。
2、输卵管整形术：引起不孕的患者，在腹腔镜下或开腹的情况下进行输卵管整形术，尽可能的保留其功能。此种情况仅用于输卵管发育异常情况不严重的且有生育要求的年轻患者，术后一定要定期随访。怀孕后积极检查，以防出现宫外孕。