脑神经痛是一大类疾病，包括常见的原发性头痛，比如偏头痛、紧张型头痛或丛集性头痛，还包括三叉神经痛、舌咽神经痛和枕神经痛等等。脑神经痛的诱因常包括过度的劳累、熬夜、情绪的紧张，以及大量的饮酒、吃巧克力等等食物。
临床还有可能是由于血管的舒缩功能异常，或者5-羟色胺受体神经递质的紊乱引起，个别与遗传因素有关。另外紧张型头痛主要是由于头部周围的肌肉筋膜受到了炎性因子的刺激导致，而丛集性头痛与下丘脑神经功能紊乱是相关的。这些疼痛的共同特点是头部影像学平扫，一般见不到明显的异常。