骨囊肿的手术费用在全国基本上都是一样的，大约在3000元左右。但是总共的花费的费用，每个地方是不一样的，具体的费用和当地的经济条件有关系，经济条件越高，总共的花费就会越高。具体的花费也和医院的级别有关系，医院的级别越高，相应的总花费也会越高。其中影响最大的还是手术当中使用的材料，因为骨囊肿刮除之后需要进行植骨，大部分情况下都使用人工骨，一般都会多出大约1万元的材料费用。