脑静脉系统血栓形成以上矢状窦血栓形成最为常见，患者最主要的症状是头痛，有明显的颅内压增高，常伴有恶心、呕吐。头痛比较严重并且为持续性，有可能还有阵发性加重，呕吐多呈喷射性，查体时还可以见到眼底的视乳头水肿。患者还常有全身症状，包括全身衰弱、乏力感，伴有发热，也有部分局灶体征，比如有时伴发颅内出血，可以出现偏瘫、失语、偏盲。脑叶皮层受累时还常会出现癫痫发作，以症状性癫痫部分性发作最为多见，少数患者有时没有局灶体征，只有头痛、呕吐等高颅压表现。