单纯性肝囊肿如果囊肿直径较小，则没有临床症状，患者没有不舒服的感觉。如果囊肿较大，压迫了周围的肝脏组织，可以出现腹痛、腹胀、肝区憋闷不适的感觉。
另外还可以出现食欲不振、恶心以及呕吐等症状，还可能伴有转氨酶升高、肝功能异常的情况。此时需要进行手术治疗，可以进行肝囊肿穿刺引流手术，能够彻底的治愈疾病。