肾囊肿通常不会自己消失，单纯性的肾囊肿是比较常见的肾脏良性疾病，也有一些肾囊肿可能跟遗传具有一定关系，主要是指多囊肾。相对来说肾囊肿的发病机制目前并不十分清楚，大多数情况下可能由于肾小管憩室发展而来，多数肾囊肿没有明显的临床症状。
肾囊肿随着年龄的增加，可能会进行性的增大，在严重情况下，囊肿也可以出现出血、腰痛，甚至引起血尿，较大的囊肿可以引起肾盂积水，合并感染可引起发热及腰痛，在临床上通过B超、CT、核磁可以进行诊断以及鉴别诊断。对于较小的肾囊肿，通常采用保守的治疗方案，较大的囊肿可以考虑进行肾囊肿开窗术。