脑组织感染炎症主要是由于病原体透过血脑屏障到达局部脑组织，从而感染脑组织细胞。其根本原因主要是机体自身免疫力低下所造成，比如长期熬夜、精神紧张、吸烟、酗酒以及受凉、失眠、营养不良的人群比较容易罹患脑炎。此外，患有糖尿病、慢性心衰、慢性阻塞性肺疾病、慢性肿瘤、艾滋病、长期服用激素的人群以及老年人、儿童也容易罹患脑炎，这些人群都是因为免疫功能低下导致病毒、细菌、结核、真菌等病原体入侵脑组织而感染。还有一些非感染性脑炎，比如由于自身免疫介导的自身免疫性脑炎也是临床上常见的脑炎类型。