由于女性泌尿系统感染主要由于致病微生物所引起，因此泌尿系感染需要吃的药物，主要选择病原体敏感的抗菌药物，常见的药物有头孢菌素类、喹诺酮类，以及磷霉素类等药物，如阿莫西林、头孢克肟、左氧氟沙星。
治疗期间需要大量的饮水、多注意休息、加强营养，不要喝酒和吃辛辣、刺激的食物，如果泌尿系统感染的患者尿频、尿急、尿痛的症状比较严重，可以在应用抗菌药物的同时联合对症治疗的药物。另外，如果是女性反复发作的泌尿系统感染，需要检查是不是有诱发尿路感染的病变，比如泌尿系统的结石、泌尿系统的梗阻，或者是畸形等原因。