异位肾由于肾盂较靠前及肾脏旋转不良，或存在异位血管压迫肾盂或上输尿管等影响尿液的正常引流，可导致肾结石或肾积水，严重可造成肾实质损伤，出现肾功能改变。异位肾由于异位到盆腔、腹部及其他部位，由于缺乏肋骨的保护，比较容易受到外力的损伤。由于异位肾的肾血管容易出现变异，可导致异位肾出现肾血管性高血压。如异位肾发育及血管均正常，可无任何异常症状及危害。