十二指肠球部炎症或者球部溃疡常用的药物包括质子泵抑制剂、H2受体阻滞剂、制酸剂、粘膜保护剂。常用的药物包括奥美拉唑、埃索美拉唑、雷尼替丁、氢氧化铝凝胶、铝碳酸镁等，可以单独也可以联合应用。明确存在幽门螺旋杆菌感染时，还应当应用质子泵抑制剂联合抗生素进行根治性治疗，常用的治疗方案包括埃索美拉唑、阿莫西林和甲硝唑，必要时还可以联合枸橼酸铋钾。