小儿心房扑动需寻找疾病病因，以消除病因为治疗原则，通过药物如洋地黄制剂或抗心律失常药物等，各种手术治疗如射频消融和电复律等方法来终止心房扑动。
一、一般治疗
1、洋地黄中毒：立即停服洋地黄，并纠正可能伴随的电解质紊乱。
2、低钾血症：通过补液纠正电解质紊乱。
二、药物治疗
1、洋地黄制剂：正常心脏新生儿或婴儿发生持续性心房扑动，1：1房室传导时，心室率极快，易致心肌病，发生心力衰竭，选用地高辛减慢心室率。预激综合征并发心房扑动时禁用地高辛，有导致严重室性心律失常，发生心脏性猝死的危险。
2、抗心律失常药物：
（1）奎尼丁：属于Ⅰ类抗心律失常药物，可用此类药物转复窦性心律，并且可预防本病复发。病态窦房结综合征并发心房扑动时用药物复律，可致心脏停搏，这点需注意。
（2）胺碘酮：属于Ⅲ类抗心律失常药物，属于广谱抗心律失常药物，对于各种室上速有效，尤其适用于伴有器质性心脏病的患者。
3、β-受体阻滞剂：普萘洛尔
伴有心脏病或心房扑动呈持续性的患者，应及时终止发作，除选用地高辛加奎尼丁外，尚可用普萘洛尔控制心室率。
4、钙通道阻滞剂：维拉帕米
非二氢吡啶类钙通道阻滞剂可控制心室率。
三、手术治疗
1、食管调搏术：是转复房扑的有效方法，尤其适用于服用大量洋地黄制剂的患儿。
2、导管消融：可根治心房扑动，对于症状明显且血流动力学不稳定的患儿应选择导管消融治疗。
四、其他治疗
同步直流电击复律效果好，用于新生儿、小婴儿且无明显心脏病者更佳。接受地高辛治疗的患儿，进行电击复律可引起严重室性心律失常，术前一天宜停服地高辛。